Sophie SCHBATH

Sophie Schbath
Directrice de Recherche, INRAE

Sophie Schbath a obtenu une thèse de doctorat en Statistique de l'Université de Paris V en octobre 1995. Elle a fait sa thèse au laboratoire de Biométrie de l'INRA (Institut National de la Recherche Agronomique) à Jouy-en-Josas, dans lequel elle a obtenu un poste permanent de chercheur en août 1996. En 1996, elle a effectué un post-doctorat d'un an à Los Angeles, dans l'équipe de Simon Tavaré et Michael Waterman. En 2000, elle a intégré le nouveau laboratoire multidisciplinaire MIG (Mathématiques, Informatique & Génome) à l'INRA-Jouy et elle a soutenu son habilitation le 22 septembre 2003. Sophie Schbath a été présidente de la Société Française de BioInformatique (300 membres) de 2010 à 2016 et elle a co-dirigé le Groupement de Recherche Français "BioInformatique Moléculaire" (1000 membres) de 2006 à 2014. Elle est désormais directrice de recherche de l'INRAE. Depuis 2015, elle est à la tête du laboratoire MaIAGE. Elle est également la responsable scientifique de l'installation de bioinformatique Migale. Son principal intérêt est de développer des méthodes statistiques pour l'analyse du génome et du métagénome. Ses objets favoris sont les motifs d'ADN sous toutes leurs formes : mots, kmers, mots dégénérés, motifs structurés, matrices de poids de position, correspondances maximales exactes, etc. Elle étudie principalement leur fréquence mais aussi leur localisation le long des génomes, en recherchant notamment les motifs co-localisés. Elle a initié et participé au développement du logiciel R'MES, qui évalue la signification statistique du nombre de motifs dans les séquences d'ADN. Ces dernières années, elle s'est particulièrement intéressée à l'étude des écosystèmes microbiens au sein de son laboratoire.